FCM是利用流式細胞儀對處在快速直線流動狀態(tài)中的單列細胞或生物顆粒進行逐個、多參數(shù)、快速的定性、定量分析或分析技術(shù)。然而，在FCM的實際應(yīng)用過程中，要想得到高質(zhì)量的流式數(shù)據(jù)卻并非易事。現(xiàn)就FCM實驗中的常見問題進行分析，希望能幫助相關(guān)實驗人員提高實驗成功率。
一、怎么選擇合適的對照？
1）同型對照：使用同型抗體做平行實驗，主要目的是消除抗體與樣本的非特異性結(jié)合。
2）陰性細胞對照：使用已知的不表達目標抗原的細胞做平行實驗，主要目的是消除抗體的非特異性結(jié)合。
3）二抗對照：第二抗體多為熒光標記的多抗，非特異性結(jié)合一般較高，可能造成基礎(chǔ)熒光值偏高，設(shè)立二抗對照平行實驗的主要目的是消除二抗的非特異性熒光著色。
4）陽性對照：一般會使用已知的高表達目標抗原的細胞做平行實驗，主要目的是排除實驗中實驗方法、試劑、操作等實驗的影響因素。
5）空白對照：不進行任何標記的細胞，主要目的是用于測定基礎(chǔ)熒光信號表達值。
二、收集的細胞通過流式儀檢測時，一般多少的細胞量合適？
進行流式檢測時，至少需要記錄5000個活細胞，一般調(diào)整細胞密度至1*106/100ul進行流式檢測。
三、FCM檢測過程中如何設(shè)門（gating）？
一般根據(jù)散射光進行設(shè)門，即我們通常所說的前散（forward scatter, FSC）和側(cè)散（side scatter, SSC）來設(shè)門。FSC的大小與細胞的直徑成正相關(guān)，不同的細胞，細胞越大，其FSC越大；反之越小。SSC的大小與細胞內(nèi)顆粒結(jié)構(gòu)的質(zhì)量成正相關(guān)，不同的細胞，細胞內(nèi)顆粒結(jié)構(gòu)越復(fù)雜，質(zhì)量越大，其SSC越大；反之越小。
四、FCM檢測過程中如何調(diào)節(jié)補償？
在FCM檢測過程中，如果存在多色，則必須進行熒光補償調(diào)節(jié)。調(diào)節(jié)補償首先要知道雙陰性細胞的情況，其次，必須要用單陽和雙陰性細胞。只有在有陰性細胞作為參照的情況下，才能既不會過多又不會過少地調(diào)節(jié)補償。
五、FCM檢測時，每次實驗的細胞數(shù)一定要相同嗎？
FCM檢測時，若不進行細胞計數(shù)而憑感覺隨意進行實驗會直接影響實驗結(jié)果。當細胞量多而抗體量不變或細胞量不變而抗體量減少，那么熒光抗體平均分布到每個陽性細胞上的量就會相對減少。由此可見，不同的細胞量會影響終的實驗結(jié)果。因此，在準備樣本時，必須進行細胞計數(shù)，使每個分組及每次實驗的細胞數(shù)保持一致。
六、FCM檢測時，如果存在多色分析，應(yīng)該如何進行配色呢？
在FCM檢測過程中，如果存在多色分析，雖然可以通過熒光補償來消除熒光光譜重疊的影響。但調(diào)節(jié)補償過大在一定程度上仍然會影響測值的準確性，因此，我們一般建議盡量選擇熒光光譜重疊少的熒光抗體組合。
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